环境科学与工程学科随三峡工程兴建应运而生，经过二十余年的建设与发展，是“十二五”“十三五”“十四五”重庆市重点学科，2013年获批成为必赢唯一官方网站首批硕士学位一级学科授权点，下设环境科学和环境工程两个专业。

本学科追踪学科发展趋势和前沿，紧密围绕三峡水库成库过程中水、陆环境与生态系统的演变等科学问题开展研究，探寻成库初期污染物环境行为、生物多样性适应性变化及其内在机制，开展生态修复和污染控制等关键技术研究与工程示范，现已形成了环境监测技术、环境污染化学、环境生态与生物技术、水质保障工程、环境生态修复工程、污染控制理论与技术等6个稳定的研究方向。

本学科拥有重庆市研究生导师团队，共有硕士生导师95人，其中，具有正高级职称58人，副高级职称34人。三峡库区环境科学重庆市野外科学观测研究站、低碳技术与服务产业学院、“三峡库区水质演变与水污染防治”市级重点实验室、国家烟气脱硫工程技术研究中心重庆万州分中心、重庆市2011协同创新中心水环境分中心、重庆绿色生态工程学院等专业平台10余个。实验室面积23000余平方米，实验设备总值2.1余亿元，有智慧教室、云平台等现代化教学交流平台，为三峡库区生态环境保护科学研究提供了可靠硬件支撑。

本学科近五年来承担国家自然科学基金、生态环境部长江驻点项目、三峡后续工程项目等三峡库区生态环境保护类科研项目100余项，其中国家自然科学基金、科技部“水专项”等国家级项目15项，省部级项目44项，企事业单位委托项目50余项，科研项目经费共计1800余万元。在ACS Nano、Water Research、Science of the Total Environment等国内外权威学术刊物上发表论文100余篇，出版专著7部，出版教材3部，授权发明专利18项。获重庆市自然科学三等奖2项，重庆市科技进步三等奖2项，重庆市自然科学优秀学术论文奖1项，万州区科技进步二等奖1项。

先后与生态环境部华南环境科学研究所、中科院重庆绿色智能研究院、重庆市环境科学研究院、长江水利委员会水文局长江上游水文水资源勘测局、北京林业大学、四川大学、重庆大学等市内外高校和科研院所在科学研究和人才培养方面建立密切合作关系。